Bei einem Rundgang durch die Schausammlungen des Botanischen Museums können Sie die Stammesgeschichte der Pflanzen (Paläobotanik) nachvollziehen und sich einen Überblick über die Vegetationverhältnisse verschiedener Erdepochen und Klimazonen (Pflanzengeographie) verschaffen. Anhand von Modellen werden Wuchsformen, Vermehrung und Fortpflanzung im Pflanzenreich - von einzelligen Organismen bis zu den höheren Pflanzen - veranschaulicht sowie in einer biologischen Abteilung Anpassungen (Morphologie und Anatomie) der Pflanzengestalt an Standort und Klima dargestellt. Breiten Raum nimmt die Abteilung Nutzpflanzen ein mit Informationen zu Herkunft, Anbau, Verarbeitung und Endprodukten der wichtigsten Kulturpflanzen. Sonderthemen sind die Geschichte der systematischen Botanik in Berlin, pflanzliche Grabbeigaben aus dem alten Ägypten und die wichtigsten Speise- und Giftpilze. Außerdem steht ein Filmvorführraum mit täglich wechselndem Programm zur Verfügung.
Zusätzlich zur Dauerausstellung werden Sonderausstellungen zu speziellen Themen aus der Welt der Pflanzen durchgeführt. Die Galerie ist der künstlerischen Sicht auf die Pflanzenwelt gewidmet.
2006 wurde die erste Museumsetage mit Hilfe des Dr.-Eva-Potztal-Fonds des Fördererkreises der naturwissenschaftlichen Museen Berlins e.V. umfassend renoviert und inhaltlich erneuert.